สำนักงานอธิการบดีเป็นหน่วยงานที่เป็นศูนย์กลางการบริหารและบริการของมหาวิทยาลัย  เป็นหน่วยงานที่จำเป็นต้องมีการประสานงานกับบุคลากรในทุกหน่วยงานของมหาวิทยาลัย  ได้แก่  ผู้บริหาร  คณาจารย์  พนักงาน  คนงาน  นักศึกษา  และผู้มาติดต่อจากภายนอก  จึงเป็นหน่วยงานที่จัดตั้งขึ้นควบคู่กับสถาบันมาโดยตลอด  ตั้งแต่มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรียังเป็นโรงเรียนฝึกหัดครูและยกฐานะเป็นวิทยาลัยครู  สถาบันราชภัฏเพชรบุรี  และมหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรี  ตามลำดับ

           แต่เดิมสำนักงานอธิการบดี  เป็นเพียง  “ฝ่ายธุรการ”  ของโรงเรียนฝึกหัดครูเพชรบุรี ต่อมาปี  พ.ศ. 2502  โรงเรียนฝึกหัดครูเพชรบุรีได้ยกฐานะเป็นวิทยาลัยครูเพชรบุรี  “ฝ่ายธุรการ”  จึงเปลี่ยนเป็น  “สำนักงานอธิการ”

            ในปี พ.ศ. 2538  มีการประกาศใช้พระราชบัญญัติสถาบันราชภัฏ  พ.ศ. 2538  วิทยาลัยครูเพชรบุรี  ได้รับการยกฐานะเป็นสถาบันราชภัฏเพชรบุรี  สำนักงานอธิการจึงเปลี่ยนเป็น  “สำนักงานอธิการบดี”  และ  พ.ศ. 2542  กระทรวงศึกษาธิการได้ออกประกาศการแบ่งส่วนราชการในสถาบันราชภัฏฉบับใหม่  ทำให้สำนักงานอธิการบดีมีภาระหน้าที่และแบ่งงานออกเป็น  4  กลุ่ม  ได้แก่  กลุ่มอำนวยการ  กลุ่มการเงินและพัสดุ  กลุ่มงานบริการ  และกลุ่มอาคารสถานที่และรักษาความปลอดภัย

             จากนั้นเมื่อวันที่  14  มิถุนายน  พ.ศ. 2547  ได้ประกาศใช้พระราชบัญญัติมหาวิทยาลัย ราชภัฏ  พ.ศ. 2547  มีผลทำให้สถาบันราชภัฏเพชรบุรี  ยกฐานะเป็น  “มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรี”

           วันที่  1  มีนาคม พ.ศ. 2548  มีกฎกระทรวง  จัดตั้งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรี  กระทรวงศึกษาธิการ  พ.ศ. 2548  ให้จัดตั้งสำนักงานอธิการบดีเป็นส่วนราชการในมหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรีและประกาศในราชกิจจานุเบกษา  หน้า  39  เล่ม  122  ตอนที่  20ก  ลงวันที่  8 มีนาคม  2548

            วันที่  22  พฤษภาคม  พ.ศ. 2549  ได้มีประกาศกระทรวงศึกษาธิการ  เรื่องการแบ่งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรี พ.ศ. 2549  ให้แบ่งส่วนราชการภายในสำนักงานอธิการบดี  ดังนี้  (1) กองกลาง  (2) กองนโยบายและแผน  (3) กองพัฒนานักศึกษา  และประกาศในราชกิจจานุเบกษา  หน้า  24  เล่ม  123  ตอนที่  62ง  ลงวันที่  29 มิถุนายน  2549  ส่งผลให้สำนักงานอธิการบดีเป็นหน่วยงานกลางในการบริหารจัดการและบริการของมหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรี  ซึ่งมีสถานภาพเป็นองค์กรที่มีบทบาทหน้าที่ความรับผิดชอบเพิ่มมากขึ้นและสภามหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรีได้แบ่งส่วนราชการในสำนักงานอธิการบดี  ดังนี้

              –  กองกลาง  ประกอบด้วย   งานบริหารทั่วไป   งานบริหารงานบุคคล  งานบริหารคลังและทรัพย์สิน   งานบริหารพัสดุ อาคารสถานที่และสาธารณูปโภค   งานประชุมและการประชาสัมพันธ์

              –  กองนโยบายและแผน  ประกอบด้วย    งานบริหารทั่วไป   งานนโยบายและยุทธศาสตร์  งานวิเทศสัมพันธ์

              –  กองพัฒนานักศึกษา  ประกอบด้วย  งานบริหารทั่วไป   งานกิจกรรมนักศึกษา งานบริการและสวัสดิการ

         ถึงแม้ว่าสำนักงานอธิการบดี  จะมีการเปลี่ยนชื่อและจัดระบบโครงสร้างหน่วยงานให้ดำเนินงานเป็นไปอย่างมีประสิทธิภาพและรวดเร็วขึ้นก็ตาม  สำนักงานอธิการบดีก็ยังคงเป็นหน่วยงานกลางในการทำหน้าที่บริหารจัดการ  ประสานงาน  ให้การสนับสนุนงานบริหารจัดการด้านผลิตบัณฑิต  การบริการวิชาการ  งานวิจัย  งานทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรม การให้ความสะดวกในด้านต่างๆตามนโยบายของมหาวิทยาลัย  ให้มีคุณภาพเพื่อความก้าวหน้าของมหาวิทยาลัยสืบไป